SeeSAR是一款著名的药物设计软件,用户涵盖拜耳、罗氏、默克等著名的国际制药公司,功能从虚拟筛选到基于片段的设计,覆盖药物发现的每一步,其高效和易于使用的特点使每一个科研工作者可以更轻松的推进研究。
SeeSAR可以安装在任何平台(Windows、Linux和Mac OS),不需要昂贵的服务器,只需要简单的下载安装,不论你是药物设计的老手,还是刚入门的新手,SeeSAR操作的极简性可以让你轻松的开始你的项目。
SeeSAR的操作主要在各种模式下进行,如蛋白模式中,只需要将目标蛋白文件拖入,或者在搜索框中搜索,蛋白就会自动呈现在窗口; 结合位点模式中,只需要鼠标点击一下,就可以自动检测配体的结合位点,当然,你也可以手动添加单个残基进行精准的扩展;
对接模式中,只需要导入配体文件,鼠标点击一下化合物,就可筛选库中的活性成分,且基于Hyde的亲和力评估,可以让你更加直观的分子配体和靶标的相互作用。
SeeSAR的操作远不止如此,如在蛋白编辑模式中,你可以直接对蛋白进行编辑,从而引入突变或自定义侧链,探究旋转异构体;
分子编辑模式中,你可以即时的对分子进行修改并使用;
分析模式中,你可以进一步计算ADME性能;
启发模式中,你可以探索新的空腔,而且基于片段的先导发现(FBLD)方法可以在数秒内提供骨架替换、分子生长和片段连接。
当然,你还可以探索更多的功能,在对接模式中,你会发现在传统的标准对接中,还有高效的模板对接,而且还具有共价对接,在共价对接基础上,我们还贴心的推出了一系列共价对接文库。
你所需要做的就是,就是下载SeeSAR,将其运用到你的研究中,并加速你的研究。
软件特点
快速
停靠、设计和分析您的化合物,并进行快速且信息丰富的计算。
视觉
通过直观的颜色代码和华丽的可视化评估配体-靶点相互作用。
easy
我们提供令人满意的即时药物设计体验。没有学习曲线!
蛋白质模式
拖放您的蛋白质,或在在线数据库中轻松搜索。几秒钟之内,您的目标就准备好了,您就可以开始了。
蛋白质编辑器模式
根据您的需要修改您的蛋白质。探索旋转异构体、引入突变并定制侧链。
用于目标口袋检测的结合位点模式
结合位点模式
SeeSAR 会自动为您检测配体的结合位点。此外,您可以通过添加单个残基来精确扩展它——或者单击一下以找到蛋白质中的空位。
用于对化合物进行即时修改的分子编辑器模式
分子编辑器模式
根据您的喜好在 2D 或 3D 中即时修改分子。完成后,分子会直接为您的任务做好准备。
用于属性评估的分析器模式
使用可视化的 HYDE 分数估计亲和力并解释结果。过滤您的化合物以获得相关参数,计算 ADME 属性,并完全控制配体-靶点相互作用。
有趣的新结构建议的吸气模式
创意无极限!发现新的支架,探索自由空腔并使其生长,或使用片段库连接分子以获得优雅的解决方案。
用于结合模式预测的对接模式
单击一次即可对接您的化合物!筛选活性成分库,并本能地评估您的结果。
相似性扫描仪模式
无需基于分子相似性的目标结构即可对齐您的化合物。
特别说明
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